Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CANXP27824 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CANXP27824 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CANXP27824 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CANXP27824 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CANXP27824 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CANXP27824 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CANXP27824 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CANXP27824 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CANXP27824 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CANXP27824 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CANXP27824 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CANXP27824 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CANXP27824 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CANXP27824 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CANXP27824 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CANXP27824 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CANXP27824 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CANXP27824 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CANXP27824 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CANXP27824 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CANXP27824 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CANXP27824 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CANXP27824 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CANXP27824 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CANXP27824 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms