Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA1P25391 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA1P25391 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms