Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRDP23468 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRDP23468 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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