Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AMPD1P23109 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMPD1P23109 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms