Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC008686.1-201ENST00000586894 565 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA4P22459 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA4P22459 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms