Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK11BP21127 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK11BP21127 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms