Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms