Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms