Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB4P17483 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms