Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA1P17096 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms