Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCFC2P16383 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms