Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSPP15924 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSPP15924 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSPP15924 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSPP15924 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSPP15924 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DSPP15924 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSPP15924 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSPP15924 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSPP15924 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSPP15924 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSPP15924 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSPP15924 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSPP15924 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSPP15924 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSPP15924 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSPP15924 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSPP15924 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSPP15924 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DSPP15924 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSPP15924 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSPP15924 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSPP15924 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSPP15924 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSPP15924 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSPP15924 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSPP15924 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSPP15924 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSPP15924 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSPP15924 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSPP15924 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSPP15924 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSPP15924 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSPP15924 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSPP15924 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSPP15924 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSPP15924 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSPP15924 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSPP15924 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSPP15924 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DSPP15924 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSPP15924 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSPP15924 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSPP15924 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSPP15924 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSPP15924 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DSPP15924 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSPP15924 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms