Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARGP13631 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARGP13631 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARGP13631 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARGP13631 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARGP13631 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARGP13631 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RARGP13631 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARGP13631 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARGP13631 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARGP13631 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARGP13631 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARGP13631 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARGP13631 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARGP13631 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RARGP13631 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RARGP13631 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARGP13631 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARGP13631 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RARGP13631 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RARGP13631 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARGP13631 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARGP13631 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARGP13631 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARGP13631 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARGP13631 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARGP13631 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARGP13631 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARGP13631 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RARGP13631 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARGP13631 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RARGP13631 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARGP13631 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARGP13631 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARGP13631 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARGP13631 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARGP13631 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARGP13631 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARGP13631 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARGP13631 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARGP13631 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARGP13631 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARGP13631 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARGP13631 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms