Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIP12755 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIP12755 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIP12755 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIP12755 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIP12755 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIP12755 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIP12755 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIP12755 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIP12755 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIP12755 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIP12755 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIP12755 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIP12755 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIP12755 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIP12755 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIP12755 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIP12755 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIP12755 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIP12755 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIP12755 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIP12755 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIP12755 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIP12755 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIP12755 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIP12755 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIP12755 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIP12755 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIP12755 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIP12755 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIP12755 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIP12755 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIP12755 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIP12755 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIP12755 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIP12755 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIP12755 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIP12755 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIP12755 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIP12755 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIP12755 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIP12755 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIP12755 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKIP12755 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKIP12755 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKIP12755 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKIP12755 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIP12755 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIP12755 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIP12755 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIP12755 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIP12755 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIP12755 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIP12755 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIP12755 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIP12755 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIP12755 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIP12755 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIP12755 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIP12755 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIP12755 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIP12755 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIP12755 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIP12755 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIP12755 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIP12755 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms