Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFHP12036 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFHP12036 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFHP12036 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFHP12036 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFHP12036 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFHP12036 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFHP12036 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFHP12036 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFHP12036 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFHP12036 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFHP12036 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFHP12036 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFHP12036 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFHP12036 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFHP12036 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFHP12036 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFHP12036 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFHP12036 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFHP12036 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFHP12036 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFHP12036 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFHP12036 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFHP12036 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFHP12036 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFHP12036 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFHP12036 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms