Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB1P11230 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms