Protein–RNA interactions for Protein: P0DP91

CSB-PGBD3, Chimeric ERCC6-PGBD3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSB-PGBD3P0DP91 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSB-PGBD3P0DP91 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CSB-PGBD3P0DP91 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSB-PGBD3P0DP91 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSB-PGBD3P0DP91 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSB-PGBD3P0DP91 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSB-PGBD3P0DP91 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSB-PGBD3P0DP91 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CSB-PGBD3P0DP91 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSB-PGBD3P0DP91 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSB-PGBD3P0DP91 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms