Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms