Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD3P0DMS9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms