Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms