Protein–RNA interactions for Protein: P0CB47

UBTFL1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL1P0CB47 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBTFL1P0CB47 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBTFL1P0CB47 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms