Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms