Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
POLA1P09884 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
POLA1P09884 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
POLA1P09884 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
POLA1P09884 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
POLA1P09884 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
POLA1P09884 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
POLA1P09884 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
POLA1P09884 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
POLA1P09884 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
POLA1P09884 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
POLA1P09884 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
POLA1P09884 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
POLA1P09884 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
POLA1P09884 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
POLA1P09884 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
POLA1P09884 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
POLA1P09884 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
POLA1P09884 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLA1P09884 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLA1P09884 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLA1P09884 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
POLA1P09884 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
POLA1P09884 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
POLA1P09884 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
POLA1P09884 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
POLA1P09884 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
POLA1P09884 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
POLA1P09884 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
POLA1P09884 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
POLA1P09884 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
POLA1P09884 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
POLA1P09884 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
POLA1P09884 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
POLA1P09884 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
POLA1P09884 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
POLA1P09884 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
POLA1P09884 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
POLA1P09884 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
POLA1P09884 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
POLA1P09884 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
POLA1P09884 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
POLA1P09884 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
POLA1P09884 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
POLA1P09884 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
POLA1P09884 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
POLA1P09884 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
POLA1P09884 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
POLA1P09884 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
POLA1P09884 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
POLA1P09884 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
POLA1P09884 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
POLA1P09884 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
POLA1P09884 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
POLA1P09884 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
POLA1P09884 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
POLA1P09884 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
POLA1P09884 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
POLA1P09884 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
POLA1P09884 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
POLA1P09884 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
POLA1P09884 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
POLA1P09884 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
POLA1P09884 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
POLA1P09884 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
POLA1P09884 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
POLA1P09884 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
POLA1P09884 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
POLA1P09884 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
POLA1P09884 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
POLA1P09884 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
POLA1P09884 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
POLA1P09884 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
POLA1P09884 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
POLA1P09884 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms