Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM2P07951 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM2P07951 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM2P07951 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM2P07951 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPM2P07951 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TPM2P07951 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPM2P07951 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPM2P07951 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPM2P07951 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPM2P07951 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPM2P07951 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPM2P07951 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPM2P07951 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms