Protein–RNA interactions for Protein: P04921

GYPC, Glycophorin-C, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPCP04921 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYPCP04921 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYPCP04921 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYPCP04921 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYPCP04921 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYPCP04921 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPCP04921 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPCP04921 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPCP04921 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPCP04921 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPCP04921 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPCP04921 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPCP04921 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPCP04921 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPCP04921 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPCP04921 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPCP04921 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPCP04921 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPCP04921 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GYPCP04921 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GYPCP04921 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GYPCP04921 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPCP04921 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPCP04921 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPCP04921 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPCP04921 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPCP04921 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPCP04921 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPCP04921 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPCP04921 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPCP04921 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPCP04921 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms