Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGGP02679 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGGP02679 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGGP02679 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGGP02679 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGGP02679 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGGP02679 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGGP02679 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGGP02679 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGGP02679 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGGP02679 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGGP02679 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGGP02679 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGGP02679 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGGP02679 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGGP02679 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGGP02679 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGGP02679 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGGP02679 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGGP02679 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGGP02679 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGGP02679 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGGP02679 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGGP02679 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGGP02679 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGGP02679 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGGP02679 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGGP02679 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGGP02679 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGGP02679 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FGGP02679 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FGGP02679 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms