Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGAP02671 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGAP02671 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGAP02671 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FGAP02671 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FGAP02671 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FGAP02671 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGAP02671 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGAP02671 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGAP02671 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGAP02671 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGAP02671 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGAP02671 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGAP02671 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGAP02671 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGAP02671 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGAP02671 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGAP02671 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGAP02671 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGAP02671 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGAP02671 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGAP02671 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGAP02671 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
FGAP02671 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGAP02671 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGAP02671 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGAP02671 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGAP02671 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGAP02671 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGAP02671 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGAP02671 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGAP02671 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGAP02671 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGAP02671 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms