Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-AP01891 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-AP01891 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms