Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMCP01189 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMCP01189 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMCP01189 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMCP01189 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMCP01189 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMCP01189 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMCP01189 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMCP01189 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMCP01189 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMCP01189 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMCP01189 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMCP01189 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMCP01189 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMCP01189 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMCP01189 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMCP01189 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMCP01189 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POMCP01189 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMCP01189 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMCP01189 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMCP01189 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POMCP01189 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMCP01189 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMCP01189 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POMCP01189 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMCP01189 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMCP01189 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POMCP01189 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMCP01189 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMCP01189 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POMCP01189 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMCP01189 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMCP01189 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMCP01189 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMCP01189 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMCP01189 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
POMCP01189 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POMCP01189 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POMCP01189 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POMCP01189 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMCP01189 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMCP01189 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POMCP01189 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms