Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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