Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBX7O95931 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBX7O95931 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX7O95931 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX7O95931 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX7O95931 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX7O95931 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX7O95931 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX7O95931 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX7O95931 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX7O95931 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX7O95931 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX7O95931 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX7O95931 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX7O95931 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX7O95931 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX7O95931 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms