Protein–RNA interactions for Protein: O95777

LSM8, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM8O95777 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM8O95777 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM8O95777 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM8O95777 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM8O95777 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM8O95777 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM8O95777 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM8O95777 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM8O95777 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM8O95777 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM8O95777 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM8O95777 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM8O95777 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM8O95777 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM8O95777 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM8O95777 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM8O95777 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM8O95777 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM8O95777 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM8O95777 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM8O95777 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM8O95777 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM8O95777 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM8O95777 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM8O95777 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM8O95777 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM8O95777 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM8O95777 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM8O95777 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM8O95777 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM8O95777 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM8O95777 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM8O95777 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM8O95777 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM8O95777 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM8O95777 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM8O95777 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM8O95777 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM8O95777 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms