Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD1O95696 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD1O95696 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD1O95696 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD1O95696 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD1O95696 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD1O95696 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD1O95696 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD1O95696 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD1O95696 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD1O95696 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD1O95696 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD1O95696 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD1O95696 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD1O95696 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD1O95696 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD1O95696 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD1O95696 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD1O95696 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD1O95696 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD1O95696 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD1O95696 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD1O95696 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD1O95696 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD1O95696 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD1O95696 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD1O95696 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD1O95696 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD1O95696 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD1O95696 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD1O95696 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD1O95696 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD1O95696 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD1O95696 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD1O95696 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD1O95696 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD1O95696 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD1O95696 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD1O95696 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD1O95696 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD1O95696 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD1O95696 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD1O95696 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD1O95696 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD1O95696 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD1O95696 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD1O95696 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD1O95696 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD1O95696 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD1O95696 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD1O95696 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD1O95696 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD1O95696 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD1O95696 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD1O95696 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD1O95696 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD1O95696 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD1O95696 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD1O95696 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD1O95696 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD1O95696 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD1O95696 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD1O95696 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD1O95696 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD1O95696 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD1O95696 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD1O95696 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD1O95696 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD1O95696 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD1O95696 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms