Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms