Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOO75962 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOO75962 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOO75962 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOO75962 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOO75962 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOO75962 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOO75962 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOO75962 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOO75962 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOO75962 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOO75962 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOO75962 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOO75962 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOO75962 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOO75962 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOO75962 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOO75962 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOO75962 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOO75962 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOO75962 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOO75962 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOO75962 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOO75962 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOO75962 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOO75962 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOO75962 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOO75962 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOO75962 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms