Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL41O60662 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms