Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms