Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8B3O60423 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B3O60423 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms