Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOBOXO60393 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms