Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3BO60391 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms