Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH3O43739 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms