Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCK2O43639 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCK2O43639 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCK2O43639 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCK2O43639 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCK2O43639 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCK2O43639 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCK2O43639 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NCK2O43639 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCK2O43639 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCK2O43639 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCK2O43639 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCK2O43639 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCK2O43639 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCK2O43639 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCK2O43639 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCK2O43639 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCK2O43639 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCK2O43639 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCK2O43639 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCK2O43639 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCK2O43639 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK2O43639 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK2O43639 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK2O43639 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK2O43639 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK2O43639 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK2O43639 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK2O43639 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK2O43639 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK2O43639 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK2O43639 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK2O43639 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK2O43639 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK2O43639 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK2O43639 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK2O43639 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK2O43639 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK2O43639 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK2O43639 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK2O43639 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK2O43639 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK2O43639 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK2O43639 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK2O43639 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK2O43639 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK2O43639 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms