Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCXO43602 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCXO43602 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCXO43602 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCXO43602 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCXO43602 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCXO43602 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DCXO43602 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCXO43602 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCXO43602 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DCXO43602 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCXO43602 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCXO43602 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCXO43602 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCXO43602 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCXO43602 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCXO43602 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCXO43602 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCXO43602 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCXO43602 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCXO43602 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCXO43602 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCXO43602 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCXO43602 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCXO43602 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DCXO43602 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCXO43602 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DCXO43602 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCXO43602 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCXO43602 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCXO43602 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCXO43602 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCXO43602 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCXO43602 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCXO43602 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCXO43602 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCXO43602 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCXO43602 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCXO43602 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCXO43602 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCXO43602 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCXO43602 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCXO43602 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCXO43602 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCXO43602 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCXO43602 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCXO43602 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCXO43602 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCXO43602 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCXO43602 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms