Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF3O43395 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms