Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms