Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPAA1O43292 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPAA1O43292 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms