Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms