Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms