Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIPC1O14908 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms