Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDC80O14777 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDC80O14777 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC80O14777 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC80O14777 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC80O14777 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC80O14777 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC80O14777 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC80O14777 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC80O14777 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC80O14777 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC80O14777 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC80O14777 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDC80O14777 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDC80O14777 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC80O14777 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC80O14777 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC80O14777 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC80O14777 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC80O14777 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC80O14777 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC80O14777 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC80O14777 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDC80O14777 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDC80O14777 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC80O14777 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC80O14777 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC80O14777 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC80O14777 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC80O14777 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC80O14777 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC80O14777 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC80O14777 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDC80O14777 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms